ดูแล รักษาผู้ป่วยโรคติดต่อ ควบคุมการแพร่ระบาดของโรค โดยเฉพาะเชื้อโรคสายพันธุ์ใหม่ที่แพร่กระจายอย่างรวดเร็วและรุนแรง พร้อมทั้งวางแผนและหาแนวทางป้องกันการแพร่กระจายเชื้อ
ศูนย์ความเป็นเลิศทางการแพทย์ โรคอุบัติใหม่ด้านคลินิก (Thai Red Cross Emerging Infectious Diseases Clinical Center) ก่อตั้งขึ้นจากคณะกรรมการอำนวยการศูนย์โรคติดต่ออุบัติใหม่ฯ ที่เล็งเห็นถึงความสำคัญของโรคอุบัติใหม่และโรคอุบัติซ้ำ เป็นสิ่งที่ต้องมีการจัดการและเตรียมรับมือเมื่อเกิดเหตุการณ์การระบาดของโรค โดยได้พิจารณาอนุมัติหน่วยงานให้เป็นส่วนหนึ่งของโรงพยาบาลจุฬาลงกรณ์ สภากาชาดไทย ปฏิบัติหน้าที่ในการให้บริการดูแลรักษาผู้ป่วยโรคติดต่อ ทั้งโรคอุบัติใหม่และโรคอุบัติซ้ำ พร้อมทั้งวางแผนและหาแนวทางป้องกันการแพร่กระจายเชื้อ มีการจัดอบรมและฝึกซ้อมแผนการรับมือผู้ป่วยกลุ่มนี้ เพื่อเตรียมความพร้อมหากมีสถานการณ์การระบาดของโรคอุบัติใหม่และโรคอุบัติซ้ำ โดยได้เริ่มปรับปรุงและแก้ไขอาคารจงกลนี วัฒนวงศ์ ชั้น 3 และ ชั้น 4 ตั้งแต่ ปี พ.ศ. 2560 เพื่อใช้เป็นสถานที่ปฏิบัติงาน
โดยชั้น 3 ถูกแบ่งออกเป็น 3 หน่วยงาน ได้แก่
ส่วนของชั้น 4 ถูกปรับปรุงให้เป็นหอผู้ป่วยโรคอุบัติใหม่ (EID Unit)
หน่วยงานเริ่มย้ายเข้าปฏิบัติงานและเปิดให้บริการอย่างเป็นทางการตามลำดับระยะเวลา ดังนี้
มุ่งควบคุมการแพร่ระบาดของโรค/เชื้อโรคสายพันธุ์ใหม่ที่แพร่กระจายอย่างรวดเร็วและรุนแรงขึ้น ด้วยการทำงานเชิงคลินิกหรือการให้บริการผู้ป่วย ด้วยการสร้างความพร้อมทั้งในเชิงโครงสร้าง อาคาร อุปกรณ์ทางการแพทย์ และระบบการปฏิบัติงาน เพื่อให้การรักษาผู้ป่วยโรคอุบัติใหม่ มีประสิทธิภาพสูงขึ้น และในขณะเดียวกันก็ต้องควบคุมไม่ให้เชื้อโรคแพร่กระจายไปสู่ผู้ป่วยโรคอื่นๆ และบุคลากรทางการแพทย์ที่เกี่ยวข้อง
โรงพยาบาลจุฬาลงกรณ์ สภากาชาดไทย จัดตั้งศูนย์ความเป็นเลิศทางการแพทย์ โรคอุบัติใหม่ด้านคลินิก เพื่อเปิดให้บริการด้านคลินิกและหอผู้ป่วยโรคอุบัติใหม่ เพื่อเตรียมความพร้อมในการรองรับผู้ป่วยสงสัยโรคอุบัติใหม่ที่เข้ารับการรักษา นอกจากการใช้นวัตกรรมทางการแพทย์เพื่อรับมือกับโรคอุบัติใหม่และโรคอุบัติซ้ำรุนแรงแล้ว การสร้างความรู้ ความเข้าใจในการป้องกันและควบคุมการติดเชื้อในโรงพยาบาลให้แก่บุคลากร ผู้เกี่ยวข้องก็เป็นอีกหนึ่งพันธกิจสำคัญที่จะผลักดันให้ศูนย์โรคอุบัติใหม่ทางคลินิก โรงพยาบาลจุฬาลงกรณ์ สภากาชาดไทย เป็นต้นแบบของงานบริการผู้ป่วยโรคติดเชื้อให้กับสถาบันทางการแพทย์อื่นๆ ทั่วประเทศ เพื่อร่วมกันควบคุมการแพร่ระบาดของเชื้อโรคในอนาคต
ศูนย์ความเป็นเลิศทางการแพทย์ โรคอุบัติใหม่ด้านคลินิก เปิดให้บริการ ณ อาคารจงกลนี วัฒนวงศ์ ชั้น 3 และ ชั้น 4 ดังนี้